Negi Springfield, 'n 10-jarige towenaar, streef daarna om uiteindelik 'n 'Magister Magi' te word, 'n besondere towenaar wat onder die dekmantel van 'n NGO sy magte gebruik om gewone individue te help. Nadat hy aan die Merdiana Magic Academy in Wallis gegradueer het, kon hy die taak om Engels te onderrig aan die middelbare skool, waar sy tuiskursus bestaan uit 31 dogters, elk op sy eie manier van Mahora Academy, opgedra word. Die skou gee 'n uiteensetting van ervarings en sy tyd in Japan terwyl hy hulle help in hul probleme, die goedkeuring en respek van sy leerlinge verkry, en magiese gevare van binne sowel as buite Mahora Akademie konfronteer. Negi se hoofverhouding is met Asuna Kagurazaka, kamermaat en sy leerling, wat hom aanvanklik nie hou nie, maar nadat hy hom as 'n vriend erken en sy metgesel word, alhoewel al die vroue haar eie rugverhaal en karakter het. Hy is ook op soek na sy pa wat die Duisend Meester genoem word.
Alhoewel dit blykbaar nog 'n romantiese komediewerk is met talle bish? Jo-karakters soos Love Hina, het die reeks tot 'n mengsel van romantiese, fantasie, horror, aksie en komedie gevorder. Akamatsu het gesê dat hy veral iets anders wil doen as Love Hina. Negi self is prepubescent, en verskeie van sy tonele met Asuna is unieke variasies van die "ongemaklike romantiese toneel" -tendens van harem manga, onmiddellik ontlont en net gelag. Daarbenewens kan baie van die meisies nie in 'n kinderagtige sin oor hom heen gaan nie, sonder verwagtinge wat intiem by die leser is. [Unieke studie?]
Om hierdie spesifieke mode te handhaaf, word Negi self beskou as ander tipiese manlike voorvalle van manga, sowel as 'n vergelyking met Love Hina se Keitaro Urashima. Hy is hardwerkend, bekwaam en vriendelik behandel, maar as gevolg van sy voorkoms en ouderdom (ver onder die meerderheid van sy leerlinge), voel hy heeltemal onbedreigend en vind hy dit moeilik om as onderwyser ernstig opgeneem te word; verskeie van sy leerlinge hanteer hom as 'n sluwe kind, indien nie 'n speelmaat (of speelgoed) nie
